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@laborjournal@mstdn.science  ·  activity timestamp 3 weeks ago

#Methode
Das neu #KI-Tool #AlphaGenome sagt voraus, wie sich Sequenzänderungen durch Mutationen z.B. auf Genexpression oder Splicing auswirken. Mit Vorhersagen zu 11 Eigenschaften ist es umfassender als bisherige Tools, dennoch ist es nicht fehlerfrei, zelltypspezifische Expression bleibt eine Herausforderung und jenseits von Maus & Mensch ist das Modell keine Hilfe.

Mehr im Artikel von Andrea Pitzschke: https://www.laborjournal.de/editorials/3425.php

#Laborjournal #LifeSci #Bioinformatik #Genomics #VariantAnalysis

2 media
Oben: Symbolgrafik zum Thema KI. Punkte winden sich in einer Spirale und werden zu Nullen und Einsen. Unten: Titel des im Post verlinkten Artikels „KI prognostiziert Varianteneffekte” sowie dessen Vorspann „Welchen Kurs schlägt ein Organismus ein, wenn Basen auf nicht-codierenden Abschnitten des Genoms mutieren? AlphaGenome kann dies einigermaßen seriös vorhersagen.“ Links daneben befindet sich ein Icon mit Smartphone und Magazinseite sowie der Schriftzug „Online lesen!“. In der rechten unteren Ecke befindet sich das Laborjournal-Logo.
Oben: Symbolgrafik zum Thema KI. Punkte winden sich in einer Spirale und werden zu Nullen und Einsen. Unten: Titel des im Post verlinkten Artikels „KI prognostiziert Varianteneffekte” sowie dessen Vorspann „Welchen Kurs schlägt ein Organismus ein, wenn Basen auf nicht-codierenden Abschnitten des Genoms mutieren? AlphaGenome kann dies einigermaßen seriös vorhersagen.“ Links daneben befindet sich ein Icon mit Smartphone und Magazinseite sowie der Schriftzug „Online lesen!“. In der rechten unteren Ecke befindet sich das Laborjournal-Logo.
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Ausschnitt aus dem verlinkten Artikel.
Ausschnitt aus dem verlinkten Artikel.
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KI-Tool AlphaGenome sagt Varianteneffekte voraus

Wollen Forschende die Folgen einer Sequenzänderung abschätzen, benötigen sie bislang verschiedene Tools. AlphaGenome hingegen kann Vorhersagen zu insgesamt elf Eigenschaften genomischer DNA tre ...
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